В связи с изменением спектра направленностей дополнительного образования детей Всероссийский конкурс методических материалов по дополнительному естественнонаучному образованию детей в 2016 году охватывал своим содержанием уже не только эколого-биологическую тематику, но и физико-географическую и физико-химическую тематические циклы, которые вместе с 2013 года входят в состав естественнонаучной направленности. Проведение Конкурса становится ежегодным и теперь основано на использовании современных информационных технологий на базе интернет-ресурса, на котором материалы представлены в электронном виде и где участники могут видеть всю необходимую информацию по Конкурсу — текущую и итоговую.
В 2017 году происходит новое изменение содержания Конкурса. Он становится Всероссийским конкурсом программ и методических материалов по дополнительному естественнонаучному образованию детей, объединяя своим содержанием и дополнительные общеобразовательные программы естественнонаучной направленности, и методические материалы, направленные на реализацию этих программ, на экологическое и трудовое воспитание детей и молодёжи, на сохранение лучших традиций юннатского движения и дополнительного естественнонаучного образования детей.
В 2018 году Конкурс посвящён 100-летию юннатского движения и системы дополнительного образования детей в Российской Федерации. В систему номинаций внесены изменения, позволяющие более широко представить эколого-биологический тематический цикл и экологическое воспитание детей и молодёжи.
В 2017 году происходит новое изменение содержания Конкурса. Он становится Всероссийским конкурсом программ и методических материалов по дополнительному естественнонаучному образованию детей, объединяя своим содержанием и дополнительные общеобразовательные программы естественнонаучной направленности, и методические материалы, направленные на реализацию этих программ, на экологическое и трудовое воспитание детей и молодёжи, на сохранение лучших традиций юннатского движения и дополнительного естественнонаучного образования детей.
В 2018 году Конкурс посвящён 100-летию юннатского движения и системы дополнительного образования детей в Российской Федерации. В систему номинаций внесены изменения, позволяющие более широко представить эколого-биологический тематический цикл и экологическое воспитание детей и молодёжи.